Одним из главных принципов уникальной «системы Физтеха», заложенной в основу образования в МФТИ, является тщательный отбор одаренных и склонных к творческой работе представителей молодежи. Абитуриентами Физтеха становятся самые талантливые и высокообразованные выпускники школ всей России и десятков стран мира.

Студенческая жизнь в МФТИ насыщенна и разнообразна. Студенты активно совмещают учебную деятельность с занятиями спортом, участием в культурно-массовых мероприятиях, а также их организации. Администрация института всячески поддерживает инициативу и заботится о благополучии студентов. Так, ведется непрерывная работа по расширению студенческого городка и улучшению быта студентов.

Адрес e-mail:

Исследование методом ЯМР фактора, обладающего антагонистическим эффектом на цианобактерии

С. А. Крачковский, А. Г. Соболь

Институт биоорганической химии РАН

Московский Физико-Технический Институт

 

Методом {}^1Н-ЯМР спектроскопии установлена пространственная структура пептидного антибиотика, синтезируемого штаммом Brevibacillus laterosporus IGM52 и обладающего активностью против цианобактерий.

Полное отнесение {}^1Н -ЯМР сигналов исследуемого пептида было получено на основании стандартной процедуры используя двумерную гомоядерную ЯМР-спектроскопию (COSY, TOCSY и ROЕSY). Проанализировав выделенные спиновые системы и взаимодействия, обусловленные ядерным эффектом Оверхаузера (ЯЭО) установили, что исследуемый образец является циклическим декапептидом [цикло (-Asn1-Asp-Tyr-Val-Orn-Leu-Tyr-Pro-Phe-Phe10-)]. Эта структура согласуется с данными масс-спектрометрии ([M^+] 1273,5).

Сравнительный анализ химической структуры данного пептида с аминокислотными последовательностями известных пептидных антибиотиков позволил установить, что исследуемое вещество соответствует антибиотику лолоатину А с химической структурой [цикло (-Asn-Asp-Tyr-Val-Orn-Leu-D-Tyr-Pro-Phe-D-Phe-)].

Для расчета пространственной структуры использовались 78 ограничений на межпротонные расстояния, полученных из анализа интенсивностей кросс-пиков в спектре ROESY, 9 ограничений на торсионные углы \phi полипептидной цепи белка, полученных из анализа значений констант спин-спинового взаимодействия (КССВ) протонов Н-NC\alpha-Н и 6 ограничений на углы \chi^1 боковых цепей белка, полученных из анализа КССВ протонов Н-C\alphaС\beta-Н. При расчете также использовались ограничения на межатомные расстояния для 4 внутримолекулярных водородных связей (ВМВС). Положение водородных связей определяли из анализа данных о зависимости химических сдвигов амидных протонов от температуры. Получен набор из 24 структур. Среднеквадратичные отклонения положений атомов по набору структур для атомов основной цепи и для всех тяжёлых атомов равны 0.44\pm0.18  \mathop A\limits^0 и 1.88\pm0.32  \mathop A\limits^0 , соответственно.

Лолоатин А стабилизирован четырьмя внутримолекулярными водородными связями NH(Asn)···CO(Val), NH(Val)···CO(Asn), NH(Leu)···CO(Phe) и NH(Phe)···CO(Leu). Боковые цепи остатков Orn и DTyr находятся по одну сторону от “плоскости”, образованной основной цепью пептида, а гидрофобные боковые цепи остатков Tyr, Val, Leu, Phe и DPhe – по другую сторону, боковые цепи остатков Asn и Asp лежат в “плоскости” основной цепи молекулы. Боковые цепи остатков Tyr, Orn и DTyr свободно вращаются вокруг связи C^{\alpha}-C^{\beta}, в то время как для боковых цепей остальных остатков существуют определённые наиболее выгодные конформации.

По своему химическому и пространственному строению лолоатин А очень похож на лолоатин В, а также на другие антибиотики тироцидиновой группы (тироцидины А, В, С и грамицидин S). Однако, возможное при физиологических значениях рН взаимодействи \varepsilon-аминогруппы остатка Orn с карбоксильной группой остатка Asp может вызвать деформацию “плоскости” циклопептида и в свою очередь повлиять на распределение зарядов и гидрофобных боковых цепей на поверхности молекулы. Перечисленные особенности строения, по-видимому, и определяют отличие лолоатина А по биологической активности от других антибиотиков тироцидиновой группы.

Если вы заметили в тексте ошибку, выделите её и нажмите Ctrl+Enter.

© 2001-2016 Московский физико-технический институт
(государственный университет)

Техподдержка сайта

МФТИ в социальных сетях

soc-vk soc-fb soc-tw soc-li soc-li
Яндекс.Метрика