Одним из главных принципов уникальной «системы Физтеха», заложенной в основу образования в МФТИ, является тщательный отбор одаренных и склонных к творческой работе представителей молодежи. Абитуриентами Физтеха становятся самые талантливые и высокообразованные выпускники школ всей России и десятков стран мира.

Студенческая жизнь в МФТИ насыщенна и разнообразна. Студенты активно совмещают учебную деятельность с занятиями спортом, участием в культурно-массовых мероприятиях, а также их организации. Администрация института всячески поддерживает инициативу и заботится о благополучии студентов. Так, ведется непрерывная работа по расширению студенческого городка и улучшению быта студентов.

Адрес e-mail:

Определение термодинамических параметров плавления триплексов ПНК2/ДНК

К. А. Случанко, О.В. Крупник, Ю.С. Лазуркин

 Московский физико-технический институт

Институт молекулярной генетики РАН

Пептидная нуклеиновая кислота – ПНК – синтетический олигонуклеотидный аналог ДНК, обладающий рядом преимуществ перед другими аналогами и природными олигонуклеотидами. Олигомеры ПНК способны узнавать комплементарные участки ДНК и образовывать как с однонитевой, так и с двунитевой ДНК прочные высокоспецифичные комплексы – дуплексы и триплексы [1]. Кроме того, ПНК не разрушается нуклеазами in vivo и, благодаря нейтральности остова, не взаимодействует с белками плазмы. Знание термодинамических характеристик ПНК и её комплексов с нуклеиновыми кислотами облегчает целенаправленный поиск и синтез новых видов ПНК, модифицированных по азотистым основаниям, по структуре основной цепи и т.д. Термодинамические параметры плавления дуплексов известны давно, однако для триплексов подобные исследования до сих пор не проводились, поскольку при плавлении триплексов, образованных обычной ПНК с ДНК, наблюдается сильный гистерезис. Чтобы преодолеть это препятствие мы использовали бис-ПНК – две цепи ПНК, соединённых гибким линкером. При плавлении триплексов, образованных однонитевой ДНК с бис-ПНК, гистерезис практически отсутствовал [2,3], что дало возможность получить равновесные кривые плавления, найти из них температуру плавления T_m и вычислить значения энтальпии \Delta H^\circ ,  энтропии \Delta S^\circ и свободной энергии \Delta G^\circ_{298} .

В работе определялись термодинамические параметры плавления триплексов, образованных  однонитевой ДНК, содержащей мишень А_{10} , с бис-ПНК, состоящей из двух декамеров Т_{10} . Были получены равновесные кривые плавления при различных концентрациях ионов натрия. Из равновесных кривых двумя методами определены термодинамические параметры плавления. Энтальпия плавления \Delta H^\circ определялась из ширины дифференциальных кривых плавления и из зависимости температуры плавления от концентрации триплекса в растворе. Последний метод позволил также определить  значение энтропии плавления \Delta S^\circ. Получены следующие результаты: \Delta H^\circ  = - 137 kcal/M, \Delta S^\circ = - 368 cal/M·K, \Delta G^\circ_{298}= - 27 kcal/M.  Обнаружено, что в пределах точности эксперимента значения \Delta H^\circ ,  \Delta S^\circ и \Delta G^\circ_{298} не зависят от ионной силы. Абсолютные значения величин \Delta H^\circ , \Delta S^\circ  и \Delta G^\circ_{298}для исследованных триплексов в 2-3 раза выше, чем соответствующие значения параметров плавления для декамерных дуплексов ПНК/ДНК различной последовательности.

 

Литература

Peptide Nucleic Acids: Protocols and Applications  (1999)  ISBN 1-898486-16-6  Horizon Scientific Press, Wymondham, UK. M. Egholm, L. Christensen, K.L. Dueholm, O. Buchardt, J. Coull, and P.E. Nielsen, Nucl. Acids Res. 23, 217-222 (1995). M.C. Griffith, L.M. Riesen, M.J. Greig, E.A. Lesnik, K.G. Sprankle, R.H. Griffey, J.S. Kiely, and S.M. Freier, J. Amer. Chem. Soc. 117, 831 –832 (1995).
Если вы заметили в тексте ошибку, выделите её и нажмите Ctrl+Enter.

© 2001-2016 Московский физико-технический институт
(государственный университет)

Техподдержка сайта

МФТИ в социальных сетях

soc-vk soc-fb soc-tw soc-li soc-li
Яндекс.Метрика