Одним из главных принципов уникальной «системы Физтеха», заложенной в основу образования в МФТИ, является тщательный отбор одаренных и склонных к творческой работе представителей молодежи. Абитуриентами Физтеха становятся самые талантливые и высокообразованные выпускники школ всей России и десятков стран мира.

Студенческая жизнь в МФТИ насыщенна и разнообразна. Студенты активно совмещают учебную деятельность с занятиями спортом, участием в культурно-массовых мероприятиях, а также их организации. Администрация института всячески поддерживает инициативу и заботится о благополучии студентов. Так, ведется непрерывная работа по расширению студенческого городка и улучшению быта студентов.

Адрес e-mail:

Полиморфизм комплексов, образуемых цитозинсодержащей бис-ПНК с двунитевой ДНК

Н. В. Фадеева, О. В. Крупник, Ю. С. Лазуркин

Московский физико-технический институт

Институт молекулярной генетики РАН

 

Пептидно-нуклеиновая кислота (ПНК) – уникальный искусственно синтезированный  аналог ДНК [1] , образующий различные комплексы с комплементарными участками нуклеиновых кислот. Наиболее стабильным и специфичным комплексом является триплекс, образуемый гомопиримидиновой ПНК с двунитевой ДНК (днДНК). Сочетание высокой стабильности и специфичности триплексов делает ПНК перспективным антигенным и анти-сенс агентом, который находит множество применений в биотехнологии, а в перспективе, и в медицине.

На авторадиограммах опытов, в которых изучалась взаимодействие цитозинсодержащей бис-ПНК с днДНК, неоднократно наблюдались [2,3] более тяжелые комплексы, чем обычный триплекс, образуемый ПНК с днДНК. Такому полиморфизму до последнего времени не уделялось должного внимания.  Между тем, это явление вносит неоднозначность в существующие методики применения ПНК.

В наших опытах при взаимодействии днДНК с бис-ПНК T_2СТ_2CТ_{4^-}Т_4JT_2JT_2 на авторадиограмме помимо свободной днДНК наблюдаются 3 комплекса. Самый легкий из них соответствует обычному триплексу. Все три комплекса образуются на одной и той же мишени. При исследовании кинетики диссоциации [4],  вместо обычно наблюдаемого экспоненциального убывания триплекса, наблюдалась более сложная картина: график зависимости концентрации триплекса от времени проходил через максимум, при этом концентрация более тяжелых комплексов убывала экспоненциально. Это позволило предположить, что именно распад более тяжелых комплексов дает вклад в рост концентрации триплексов. Изучение отдельно выделенных комплексов и триплекса показало, что они действительно распадаются по экспоненциальному закону. Комплексы оказались достаточно устойчивыми (их время жизни в диапазоне температур 60-70^\circС составляет порядка десятков минут), но менее устойчивыми, чем триплекс. Для изучаемых по отдельности  комплексов на основании этих данных была построена модель диссоциации, которая позволила определить относительный выход ДНК и триплекса. Для обоих комплексов он ,как правило, составляет, с учетом погрешности эксперимента, 1:1.

На данный момент изучение полиморфизма продолжается с целью конкретизировать состав и структуру комплексов, научиться управлять процессом их образования. Задача эта чрезвычайно важна, так как тот факт, что один комплекс, образуемый ПНК с днДНК, переходит в другой, может отразиться на применении ПНК.

            Литература

Peptide Nucleic Acids: Protocols and Applications (1999) ISBN 1-898486-16-6 Horizon Scientific Press, Wymondham, UK G. Hansen, T. Bentin, H. Larsen and P. Nielsen. Structural Isomers of bis-PNA Bound to a Target in Duplex DNA. J.Mol.Biol. 307, p.67-74, 2001 H. Kuhn, V.V. Demidov, P.E. Nielsen and M.D. Frank-Kamenetskii.                  An Experimental Study of Mechanism and Specificity of Peptide Nucleic Acid (PNA) Binding to Duplex DNA. J.Mol.Biol  286, p. 1337-1345, 1999 Y.N. Kosaganov, D.A. Stetsenko, E.N. Lubyako, N.P. Kvitko, Yu.S. Lazurkin,  P.E. Nielsen ,  Effect of temperature and ionic strength on the dissociation kinetics and lifetime of PNA-DNA triplexes. Biochemistry 39, 11742-11747, 2000.
Если вы заметили в тексте ошибку, выделите её и нажмите Ctrl+Enter.

© 2001-2016 Московский физико-технический институт
(государственный университет)

Техподдержка сайта

МФТИ в социальных сетях

soc-vk soc-fb soc-tw soc-li soc-li
Яндекс.Метрика