Адрес e-mail:

Лаборатория молекулярной онкологии

Основная задача, стоящая перед лабораторией


Выяснение молекулярной роли белка p73 в онкогенезе и противоопухолевом иммунитете.


В рамках задачи по изучению молекулярной роли глобального регулятора клеточных механизмов - белка p73 - в возникновении и развитии злокачественных опухолей легкого и желудочно-кишечного тракта, мы планируем:


Создание биобанка злокачественных опухолей от пациентов и клеточных культур из этих опухолей. Анализ этих клеток на наличие мутаций в ключевых генах – p52, p73, p14, p19, EGFR, p16, Myc, Kras, SCLC1, PTEN, и других – путем полногеномного секвенирования с помощью специальной панели. Это позволит нам узнать статус p53 и p73 и рассортировать, в соответствии с этим, опухоли.


Разработка нового метода для скрининга опухолей с помощью уникальной панели антител селективно узнающих различные изоформы белка p73. 


Разработка нового метода безмаркерной селекции для редактора оснований АВЕ (Cas9-Tad10.7). Этот подход позволит выполнять селекцию клеток без необходимости введения в геном дополнительных селективных маркеров и станет высокоэффективным и безопасным методом клеточного клонирования в случае низкого уровня начальной модификации, особенно подходящим при создании линий клеток для применения в клеточной терапии. В качестве примера эффективности такого метода будут внесены модификации в ген p73 в отобранных, на основании предыдущих этапов, клеточных линиях из опухолей пациентов. 


С помощью предлагаемого выше метода, будут выбраны образцы опухолей и полученные из них клеточные линии, различающиеся между собой составом и экспрессией изоформ белка p73. Будут проанализированы различия в транскриптомных профилях соответствующих клеток, включая как кодирующие, так и некодирующие последовательности РНК. Будет проведен сравнительный анализ структуры хроматина методами (а) ChIP seq с антителами к тотальному гистону H3, H3K9me3, H3K4me3, RNAPolII, p300; (b) ATAC-seq и (c) Hi-seq  - что позволит выяснить особенности трехмерной структуры хроматина в ядрах соответствующих клеток.


  1. Будут исследованы метаболомные профили клеток линии H1299, клеток, полученных из этой линии путем делеции белка p73, а также полученные из образцов опухолей клеточные линии, различающихся между собой составом и экспрессией изоформ белка p73. Будет исследован протеомный состав p73-aссоциированных белковых комплексов, полученных в результате их аффинной очистки из этих же клеточных популяций, с использованием специфических антител к соответствующим изоформам p73.

  2. Валидация предварительных данных об ассоциации белка p73 c белками Jhd2c, Smrf2h и p300, путем иммунопреципитации белка p73 с последующим иммуноблоттингом.


В рамках задачи по разработке и изучению новых перспективных средств для доставки лекарственных препаратов в опухоли желудочно-кишечного тракта будет проведено изучение подобных экзосомам животных нановезикул растений и их свойств. Будет предпринято клонирование миРНК с доказанной цитотоксической активностью в отношении клеток опухолей, таких как miR34a, а так же p73- специфических миРНК, в клетках растений. Затем будет предпринято выделение частиц с ксеногенными (трансгенными) миРНК, определение относительной доли трансгенных миРНК в общем пуле малых миРНК в частицах из плодов генно-модифицированных растений, а также способность этих частиц передавать трансгенные миРНК в клетки из опухолевых клеточных культур, и наконец – выяснение цитотоксических свойств в отношении клеток опухолей в результате воздействия трансгенных миРНК, передаваемых рекомбинантными нановезикулами, на молекулярные механизмы в клетках опухолей.



Если вы заметили в тексте ошибку, выделите её и нажмите Ctrl+Enter.

© 2001-2020 Московский физико-технический институт (национальный исследовательский университет)

Противодействие коррупции | Сведения о доходах

Политика обработки персональных данных МФТИ

Техподдержка сайта | API

Использование новостных материалов сайта возможно только при наличии активной ссылки на https://mipt.ru

МФТИ в социальных сетях