Адрес e-mail:

Доклад об исследовании разнообразия белков семейства родопсинов в МФТИ

Доклад об исследовании разнообразия белков семейства родопсинов в МФТИ

18 октября в 14:30 в поточной аудитории Физтех.Цифры будет прочитан доклад «Novel approaches and metagenomic developments to analyze environmental rhodopsin diversity» в рамках международного семинара «Молекулярные механизмы старения и возрастные заболевания».

Докладчик — Риккардо Росселли (Riccardo Rosselli) из Королевского нидерландского института морских исследований (NIOZ).

Microbial rhodopsins are encoded by Prokaryotes, unicellular Eukaryotes and viruses and represent the evolutive response of heterotrophs to the natural light utilization. The advent of culture-independent DNA sequencing approaches has shed novel insights into the astonishing variety that characterizes microbial genomes. The possibility to analyze nucleic acids directly extracted from the environment, encouraged global sampling expeditions (e.g., TARA-Oceans, Malaspina, OSD-consortium) aimed at exploring genomic composition and diversity of entire ecosystems, and providing public available data for the scientific community. 

This data definitively showed that microbial rhodopsins previously known from culture collections barely represent the diversity that the group has in oceans and other aquatic environments. Current bioinformatic approaches to analyze environmental gene diversities, are largely based on sequence similarity searches. They allowed to retrieve novel rhodopsin groups and rhodopsins with novel functions. Nevertheless, in order to expand the knowledge about this protein family, the research for environmental rhodopsins should upgrade algorithms and develop approaches that might allow to investigate also on clades which sequences remarkably diverge from those which are already known, as the novel group of microbial rhodopsins of type-3. To achieve this objective, a bioinformatic platform is is being set that might spot divergent rhodopsins and proteins that for the moment represent the dark side of the natural light utilization.

Семинар пройдет на английском языке. Приглашаются все желающие. Для участия необходимо зарегистрироваться.

Международный семинар организован Центром исследований молекулярных механизмов старения и возрастных заболеваний Физтех-школы физики и исследований имени Ландау. Цель семинара — обсуждение ключевых достижений в различных направлениях клеточной и молекулярной биофизики. Доклады рассказывают о передовых биофизических методах, включая современную флуоресцентную и криоэлектронную микроскопию, кристаллографию и их применение к таким задачам, как исследование молекулярных механизмов старения, рака, нейродегенеративных, сердечно-сосудистых и инфекционных заболеваний.

Если вы заметили в тексте ошибку, выделите её и нажмите Ctrl+Enter.

МФТИ в социальных сетях