В 2011 году в составе ФФКЭ была создана Кафедра функциональной наноэлектроники. Кафедра занимается подготовкой специалистов по магистерской программе "Физика и технология наноэлектронных приборов".
В качестве базовой организации кафедры выступает ОАО «НИИ молекулярной электроники», работа которого базируется на самой передовой в России промышленной технологии производства интегральных микросхем. ОАО «НИИМЭ» сегодня нацелено на возрождение микроэлектроники и развитие в России новых направлений науки и техники.
