Специальные главы биостатистики

Рубанович Александр Владимирович проф., д.б.н. rubanovich@vigg.ru Институт общей генетики им.Вавилова Лаборатория экологической генетики

Программа курса:

1. Введение.
   1. Миссия биостатистики;
   2. Комбинаторика;
   3. Распределение Бернулли;
   4. Точные тесты в статистике;
   5. One- and two-tailed tests;
   6. Ресурсы: свободно распространяемое программное обеспечение, интернет-курсы
2. Статистические вычисления.
   1. База данных в Excel;
   2. Описательная статистика;
   3. Доверительный интервал;
   4. Графическое представление данных.
3. Проверка статистических гипотез.
   1. Нормальное распределение и Z-статистика;
   2. Ошибки первого и второго рода;
   3. Statistical power;
   4. Планирование эксперимента.
4. Особенности анализа вычислений.
   1. Т-критерий Стьюдента;
   2. Критерии сравнения значений;
   3. Сравнение дисперсий;
   4. F-тест; дисперсионный анализ;
   5. Непараметрические методы;
   6. U-критерий Манна-Уитни.
5. Анализ численных гипотез.
   1. Критерий согласия Пирсона;
   2. Равновесие Харди-Вайнберга;
   3. Таблица сопряженности;
   4. Анализ гомогенности.
6. Анализ статистической зависимости.
   1. Регресионный анализ;
   2. Коэффициент корреляции;
   3. Дискретные переменные в регрессии;
   4. Относительный риск и коэффициент несогласия;
   5. Логистическая регресия и пробит.
7. Мета-анализ.
   1. Стратификация и парадокс Симпсона;
   2. Стандартная величина эффекта;
   3. Метод обратной дисперсии;
   4. Модель со случайными и фиксированными эффектами;
   5. «Проклятие победителя» и систематическая ошибка.
   6. Ресурсы: свободно распространяемое программное обеспечение.
8. Множественные сравнения.
   1. Поправка по методу Бонферрони;
   2. Анализ ложноположительных результатов;
   3. Критерий перестановок.
9. Байесовская статистика.
   1. Условные вероятности;
   2. теорема Байеса;
   3. Коэффициенты Байеса;
   4. Большие выборки;
   5. Байесовское оценивание.
   6. Ресурсы: свободно распространяемое программное обеспечение.
10. Диагнистические испытания: прогностические значения.
    1. Исследование типа «случай-контроль»;
    2. Чувствительность, специфичность и прогностичность положительного результата;
    3. ROC-анализ;
    4. AUC and balanced accuracy;
    5. Ресурсы: свободно распространяемое программное обеспечение.

Список публикаций:

1. А.В.Рубанович. 1978. Общая модель процесса поражения и форма кривой доза-эффект. Сообщение 1. Число этапов в поражении. Радиобиология, т.18, 2, с.246–252.

2. А.В.Рубанович. 1978. Метод получения оценок параметров динамического процесса марковского типа. Автоматика и телемеханика, 12, с.118–124.

3. В.К.Равин, А.В.Рубанович. 1982. Географическое видообразование и количественная структура таксона. Докл.акад.наук СССР, т.263, 1, с.247–250.

4. А.В.Рубанович. 1982. Марковские случайные поля в популяционной генетике. Взаимодействующие марковские процессы и их применение к математическому моделированию биологических систем. Пущино, с.118–122.

5. A.Fetisov, A.Rubanovich, T.Slypchenko, V.Shevchenko. 1992. The structure of Dreissena polymorpha populations from basings adjacent to the Chernobyl APS. The Sience of the Total Environment, V.112, 115–124.

6. V.Shevchenko, G.Snigiryova, A.Rubanovich. 1998. Estimation of Absorbed Doses on the Basis of Cytogenetic Methods.Res.Activities about the Rad.Cons.of the Cher.NPS Accident. Kyoto Univers., 1998, pp.216–222.

7. M.Durante, G.Snigiryova, E.Akaeva, A.Bogomazova, S.Druzhinin, B.Fedorenko, O.Greco, N.Novitskaya, A.Rubanovich, V.Shevchenko, U.von Recklinhausen. Chromosome aberration dosimetry in cosmonauts after single or multiple space flights. Cytogenet. Genome Res. V.103. P.40–46.

8. А.В.Рубанович, Г.П.Снигирева, В.А.Шевченко, Э.А.Акаева, Т.В.Елисова, Г.И.Кузнецова, И.Н.Нилова, Э.Л.Иофа. Теория и практика построения калибровочных кривых в биодозиметрии. Радиобиология. Радиоэкология., 2006, Т.46, №6, 447–456.

9. S.Mughal, A.Myazin, L.Zhavoronkov, A.Rubanovich, Y.Dubrova. The dose and dose-rate effects of paternal irradiation on transgenerational instability in mice: a radiotherapy connection. PLoS One. Jul.24, 2012, 7(7).

10. L.Salnikova, A.Chumachenko, O.Belopolskaya, A.Rubanovich. Correlations between DNA polymorphism and frequencies of gamma-radiation induced and spontaneous cytogenetic damage. Health Phys., 2012; 103(1): 37–41.