Настоящее структурное подразделение ранее называлось Кафедрой молекулярной физики. Кафедра молекулярной физики была выделена в самостоятельное подразделение в 1975 году для обеспечения общефакультетской подготовки.
В данный момент происходит реорганизация структурного подразделения. Новое название - Департамент молекулярной и биологической физики. Департамент относится к Школе живых систем, куда входит еще одно структурное подразделение - Лаборатория ионной и молекулярной физики. Руководителем департамента и лаборатории является к.ф.-м.н., доцент Попов Игорь Алексеевич.
Департамент молекулярной и биологической физики ФМХФ базируется в МФТИ. Здесь работают около 20 высококвалифицированных преподавателей (более половины из них — совместители) и около 15 научных сотрудников.
Важная функция департамента — обеспечение организационной деятельности на факультете. Все сотрудники деканата, кураторы курсов работают в данном департаменте. Мы считаем, что очень эффективно взаимодействие со студентами преподавателей и научных работников, которые в недавнем прошлом являлись выпускниками факультета, и именно таких людей стараемся привлекать в департамент, причем так, чтобы были представлены все базовые кафедры факультета.
Департамент имеет прямые связи с рядом ведущих университетов США и Западной Европы. Наиболее тесные контакты с университетом Мэриленд графства Балтимор (США), университетом Д. Хопкинса (США), университетом Вирджнии (США). Практикуются регулярные взаимные обмены преподавателями, научными сотрудниками, аспирантами и студентами старших курсов, чтение лекций, проведение совместных семинаров.