Одним из главных принципов уникальной «системы Физтеха», заложенной в основу образования в МФТИ, является тщательный отбор одаренных и склонных к творческой работе представителей молодежи. Абитуриентами Физтеха становятся самые талантливые и высокообразованные выпускники школ всей России и десятков стран мира.

Студенческая жизнь в МФТИ насыщенна и разнообразна. Студенты активно совмещают учебную деятельность с занятиями спортом, участием в культурно-массовых мероприятиях, а также их организации. Администрация института всячески поддерживает инициативу и заботится о благополучии студентов. Так, ведется непрерывная работа по расширению студенческого городка и улучшению быта студентов.

Адрес e-mail:

Олейникова Наталья Васильевна

Кратко:

Диссертант: Олейникова Наталья Васильевна Название диссертации: "Выравнивание аминокислотных последовательностей: анализ существующих методов и разработка новых алгоритмов" Дата защиты: 25.03.2004 Язык диссертации: русский Ученая степень, отрасль науки: кандидат физико-математических наук Шифр специальности: 03.00.02 - Биофизика

Цель работы: Оценить качество восстановления структурных выравниваний методом Смита-Уотермана (SW), выявить причины неточного восстановления структурных выравниваний. На основе проведенного исследования разработать новый метод выравнивания аминокислотных последовательностей.

Основные результаты: Получена зависимость качества восстановления выравнивания пространственных структур белков по аминокислотным последовательностям с помощью метода SW. Показано, что индивидуальный подбор штрафов за делеции для каждой пары белков может увеличить качество выравниваний незначительно (~10%). Установлена причина значительных отличий между выравниваниями последовательностей и структурными выравниваниями белков - это наличие большого числа безделеционных участков, имеющих малый вес в структурных выравниваниях. Разработан новый алгоритм ANCHOR выравнивания последовательностей, учитывающий вес только положительной основы (ядра) острова. Новый алгоритм не уступает в качестве восстановления структурного выравнивания методу SW, но работает в ~2 раза быстрее. Алгоритм ANCHOR адаптирован для построения выравнивания последовательности и профиля. Он так же хорошо восстанавливает структурные выравнивания, как и SW, но работает быстрее более чем в 2 раза. Разработана программа поиска гомологов по банку данных (Search-Anchor). Search-Anchor работает в 3 раза быстрее программы SW_FASTA (алгоритм SW), и в 1.5 раза быстрее программы SSEARCH (упрощенная реализация SW). Качество списков гомологов, которые строятся программой Search-Anchor незначительно (менее 1%) уступает качеству списков программ SW_FASTA и SSEARCH.  Результаты м. б. использованы в ИБ РАН, ИМБ РАН, ИМГ РАН, ИЦГ СО РАН, МГУ, ГНЦ "НИИГенетика".

Доступные материалы:

Текст автореферата (doc/zip, 139 Кб) Текст диссертации (doc/zip, 474 Кб)
Если вы заметили в тексте ошибку, выделите её и нажмите Ctrl+Enter.

© 2001-2016 Московский физико-технический институт
(государственный университет)

Техподдержка сайта

МФТИ в социальных сетях

soc-vk soc-fb soc-tw soc-li soc-li
Яндекс.Метрика