Одним из главных принципов уникальной «системы Физтеха», заложенной в основу образования в МФТИ, является тщательный отбор одаренных и склонных к творческой работе представителей молодежи. Абитуриентами Физтеха становятся самые талантливые и высокообразованные выпускники школ всей России и десятков стран мира.

Студенческая жизнь в МФТИ насыщенна и разнообразна. Студенты активно совмещают учебную деятельность с занятиями спортом, участием в культурно-массовых мероприятиях, а также их организации. Администрация института всячески поддерживает инициативу и заботится о благополучии студентов. Так, ведется непрерывная работа по расширению студенческого городка и улучшению быта студентов.

Адрес e-mail:

Введение в метагеномику

Даниленко Валерий Николаевич

проф., д.б.н.

valerid@vigg.ru

Институт общей генетики им. Вавилова РАН

Лаборатория генетики микроорганизмов

 

 Danilenko_Valerii_Nikolaevich_01

Программа курса

  1. Микробиота (микробиом) человека
    1. Разнообразие бактерий в желудочно-кишечном тракте человека
    2. Открытие нескольких энтеротипов кишечника человека
    3. Создание основы для диагностики различных заболеваний с использованием параметров микробиома
    4. Формирование крупных национальных и международных проектов
    5. Возможность использования знаний для нового направления персонализированной медицины
  2. Микробиота как новый орган; функции в норме и при патологии
    1. Микробиота человека и его здоровье
    2. Микробиота – часть метагенома человека
    3. Кишечная микробиота при развитии и болезни
  3. Пробиотики – применение, механизмы действия, перспективы использования
    1. Основа метаболического взаимодействия между хозяином и его кишечной микробиотой
    2. Пробиотические микроорганизмы – ключевой основной компонент микробиоты человека
  4. Постгеномные технологии (-омики), используемые при изучении микробиоты (микробиома) человека
    1. Сравнительная функциональная геномика
    2. Метагеномика
    3. Транскриптомика
    4. Протеомика
    5. Метаболомика
  5. Функциональные биомаркеры (гены) для диагностики и метагеномного анализа
    1. Классификация систем токсин-антитоксин бактерий
    2. Системы токсин-антитоксин II типа у бактерий микробиома человека
  6. Биомишени и механизмы действия систем токсин -антитоксин II типа
  7. Сравнительная геномика бактерий микробиоты кишечника человека.
    1. Сравнительная геномика бифидобактерий
    2. Сравнительная геномика лактобацилл
    3. Сравнительная геномика бактерий других филотипов микробиома кишечника человека
  8. Достижения и перспективы исследования микробиоты (микробиома) человека
    1. Разработка компьютерных программ для метагеномного анализа существующих баз данных микробиома человека
    2. Создание основ для персонализированной медицины в области диагностики и лечения заболеваний, определяемых нарушениями микробиоты человека

 Список публикаций

  1. Schloissnig S, Arumugam M, Sunagawa S, Mitreva M, Tap J, Zhu A, Waller A, Mende DR, Kultima JR, Martin J, Kota K, Sunyaev SR, Weinstock GM, Bork P. 2013. Genomic variation landscape of the human gut microbiome. Nature. V.493. N 7430. P.45-50.
  2. Bengmark S. 2012 Gut microbiota, immune development and function. Pharmacol Res. pii: S1043-6618(12)00166-1.
  3. Palmer C, Bik EM, Digiulio DB, Relman DA, Brown PO. 2007. Development of the Human Infant Intestinal Microbiota. PLoS Biol 5:e177.
  4. Nicholson JK, Holmes E, Kinross J, Burcelin R, Gibson G, Jia W, Pettersson S. 2012 Host-gut microbiota metabolic interactions. Science. V.336. N 6086. P.1262-7.
  5. Flint HJ, Scott KP, Louis P, Duncan SH. 2012 The role of the gut microbiota in nutrition and health. Nat Rev Gastroenterol Hepatol. V.10. N 5. P.577-89.
  6. Kelsen JR, Wu GD. 2012. The gut microbiota, environment and diseases of modern society. Gut Microbes. V.3. N 4. P.374-82.
  7. Turroni F, Ribbera A, Foroni E, Douwe van Sinderen,Ventura M. 2008. Human gut micribiota and bifidobacteria: from composition to functionality. Antonie van Leeuwenhoek.V.94.P.35-50.
  8. Tilg H, Kaser A. 2011 Gut microbiome, obesity, and metabolic dysfunction. J Clin Invest. V.121. N.6. P.2126-32.
  9. Ventura M, O’Flaherty S, Claesson MJ, Turroni F, Klaenhammer TR, van Sinderen D, and O’Toole PW. 2009. Genome-scale analyses of health-promoting bacteria: probiogenomics. Nat Rev Microbiol.V. 7.P. 61-71.
  10. Thum C, Cookson AL, Otter DE, McNabb WC, Hodgkinson AJ, Dyer J, Roy NC. 2012. Can Nutritional Modulation of Maternal Intestinal Microbiota Influence the Development of the Infant Gastrointestinal Tract? J Nutr. V.142. N 11. P.1921-1928.
  11. Yamaguchi Y, Park JH, Inouye M. 2011. Toxin-antitoxin systems in bacteria and archaea. Annu Rev Genet. V.45. P.61-79.
  12. Danilenko V.N., Averina O.V., Alekseeva M.G., Klimina K.M., Poluektova E.U. 2012. The Toxin-Antitoxin System Gene Polymorphism As a Marker for Species and Strain Identification of the Probiotic Component of Human Microbiome. Abstracts of International Human Microbiome Congress. Paris. P.19-21.
  13. Structure, function and diversity of the healthy human microbiome. 2012. Nature. V.486. P.207-214.
  14. Arumugam M., Raes J, Pelletier E, Le Paslier D. et al. 2011. Enterotypes of the human gut microbiome Nature. V.473. N7346. P.174-180.
  15. Morgan XC, Segata N, Huttenhower C. 2013. Biodiversity and functional genomics in the human microbiome. Trends in Genetics. V.29. N1. P.51-58.
  16. Segata N, Waldron L, Ballarini A, Narasimhan V, Jousson O, Huttenhower C. 2012. Metagenomic microbial community profiling using unique clade-specific marker genes. Nat Methods. V.9. N 8. P.811-814. [24]. Schloissnig S, Arumugam M, Sunagawa S, Mitreva M, Tap J, Zhu A, Waller A, Mende DR, Kultima JR, Martin J, Kota K, Sunyaev SR, Weinstock GM, Bork P. 2013. Genomic variation landscape of the human gut microbiome. Nature. V.493. N 7430. P.45
Если вы заметили в тексте ошибку, выделите её и нажмите Ctrl+Enter.

© 2001-2016 Московский физико-технический институт
(государственный университет)

Техподдержка сайта

МФТИ в социальных сетях

soc-vk soc-fb soc-tw soc-li soc-li
Яндекс.Метрика