Одним из главных принципов уникальной «системы Физтеха», заложенной в основу образования в МФТИ, является тщательный отбор одаренных и склонных к творческой работе представителей молодежи. Абитуриентами Физтеха становятся самые талантливые и высокообразованные выпускники школ всей России и десятков стран мира.

Студенческая жизнь в МФТИ насыщенна и разнообразна. Студенты активно совмещают учебную деятельность с занятиями спортом, участием в культурно-массовых мероприятиях, а также их организации. Администрация института всячески поддерживает инициативу и заботится о благополучии студентов. Так, ведется непрерывная работа по расширению студенческого городка и улучшению быта студентов.

Адрес e-mail:

Прикладная биоинформатика

 

Баранова Анча Вячеславовна

проф., д.б.н.

abaranov@gmu.edu

George Mason University

School of Systems Biology


 ancha

Скоблов Михаил Юрьевич

к.б.н.

mskoblov@gmail.com

Медико-Генетический Научный Центр

Лаборатория генетической эпидемиологии


skoblov 

Описание курса:

  Целью данного курса является развитие навыков биоинформатического анализа генов для оценки их функциональной роли в клетке и патогенезе заболеваний. Данный курс включает в себя 2 пары в неделю, одна из пар – преподавание теории, a вторая пара – самостоятельная работа студентов по использованию биоинформатических инструментов для выявления структурно-функциональных особенностей конкретных генов человека. Частью данного курса будет обучение правильному представлению результатов биоинформатического анализа в виде русскоязычных или англоязычных статей, устных докладов и постеров.

На начало курса каждому студенту будет выдан описанный в литературе кандидатный локус для конкретного заболевания человека. В среднем. Каждый локус будет содержать около десяти генов, как хорошо известных, так и не описанных. По окончанию курса студенты сдают устный зачет по теоретической части и написанный текст аналитической статьи по биоинорматическому анализу локуса. В случае, если качество проведенного в рамках самостоятельной работы анализа будет достаточно высоким, студенту будет предложено доведение результатов анализа до публикации в рамках курсовой или дипломной работы, которая может включать как аналитические так и экспериментальные разделы. Ожидается, что аналитический постер, созданный студентом в рамках курса будет представлен на ежегодной конференции Moscow Conference on Computational Molecular Biology в следующем году после окончания курса - то есть до окончания студентом его/ее дипломной работы.

В теоретический материал курса войдут следующие аспекты:

 

  1. Исследование структуры локуса
    1. анализ мРНК и EST
    2. анализ данных RNAseq
    3. Повторы
    4. Псевдогены
    5. Некодирующие траскрипты
  2. Исследование кодирующего потенциала гена, определение белковых изоформ продукта, анализ доменной структуры белка, анализ паралогов белка в геноме человека
  3. Анализ экспрессии генов
    1. На основе данных микрочипов Affymetrix
    2. На основе данных RNAseq
    3. Особенности анализа экспрессии генов в опухолях и при исследовании хронических заболеваний человека
  4. Изучение регуляции локуса
    1. Регуляция с помощью miRNA
    2. Антисмысловые взаимодействия
    3. Транскрипционные факторы
    4. Гистоновые модификации
    5. Метилирование
    6. Чувствительность к ДНКазам
  5. Анализ полиморфизма в гене, синонимичные и несинонимичные замены, вариации дозы гена
  6. Сравнительно-геномный анализ локуса, консервативность гена, эволюция локуса.
  7. Анализ функции белка
    1. Выявление белковых партнёров
    2. Пост-трансляционные модификации белка
    3. Предсказание функции белка на основе его взаимодействий с белками-партнерами
    4. Анализ клеточных путей
  8. Синтетический анализ и систематическое описание функции генов-кандидатов с целью их приоритизации для экспериментальных исследований
  9. Общая теория дизайна лабораторного эксперимента
  10. Теория по написанию статей, приготовлению усных и постерных сообщений.
Если вы заметили в тексте ошибку, выделите её и нажмите Ctrl+Enter.

© 2001-2016 Московский физико-технический институт
(государственный университет)

Техподдержка сайта

МФТИ в социальных сетях

soc-vk soc-fb soc-tw soc-li soc-li
Яндекс.Метрика